Samlingene består av gjenstander av kulturhistorisk og arkeologisk opphav, kunstverk, fartøy, fotografier, skips- og båttegninger, privatarkiv, kart, bøker og tidsskrifter.
Museet har enkelte deponier i samlingen. Blant disse er en samling på 660 objekter fra Redningsselskapets virksomhet, som ble deponert til Norsk Maritimt Museum i 2009, og som har dannet utgangspunkt for formidling og utstillingsprosjekter.