Fra 2005 til 2008 pågikk feltundersøkelsene i forbindelse med anleggelsen av senketunnelen. Senketunnelprosjektet ga 13 båtfunn av varierende grad av kompletthet, med dateringer fra tidlig 1600-tall og frem til 1900-tallet. Dertil kommer blant annet ca. 7000 gjenstander med et vidt spekter av dateringer, samt rester av skipsverft og kaifronter fra 1800-tallet.
Arkeologiske rapporter fra museets undersøkelser i Senketunneltraseen finner du her: