Undersøkelsen, som startet i 2003, resulterte i funn av blant annet en skipskran, bryggeanlegg og gjenstander fra slutten av 1700-tallet og fremover. En lekter og en liten færing ble også funnet, begge med antatt datering til 1700-tallet. Det ble i tillegg registrert opptil 8 meter tykke sagflislag på tomta.
Operaprosjektet
Den første store arkeologiske undersøkelsen i Bjørvika gjennomført av museet var Operaprosjektet, overvåkingen av utsjaktingen av den nye operatomten.