I 1965 ble det funnet fragmenterte rester av en båt i forbindelse med anleggelsen av T-banen ved Jernbanetorget. Båtrestene ble datert til mellom ca. 1660 og 1730. Det ble ikke funnet noen båt i 2008, men til gjengjeld sjøavsatte masser med over 800 gjenstandsfunn, blant annet en huggert og godt bevarte, dekorerte tekstiler fra tidlig 1700-tall.
I 2014 var NMM dessuten engasjert i et samarbeidsprosjekt med Byantikvaren om overvåkning av gravearbeidene i forbindelse med ombyggingen av Østbanehallen, hvor det ble funnet ballastmasser og påler tolket som mulige rester av en brygge. Det hører til sjeldenhetene for våre arkeologer at utgravningene foregår innendørs!