Det forskes for tiden på en rekke ulike små og store emner ved museet, til dels sammen med kolleger ved andre museer og i universitets- og høyskolesektoren, bl.a. disse:
- Norske sjøfolks historie i nyere tid
- Havneplasser, båt- og skipsfunn fra middelaldere og nyere tid i Oslo og andre steder
- Krittpiper, keramikk og andre importvarer i det arkeologiske materialet fra forvaltningsprosjektene
- Antikke og bysantinske havner på Naxos, Hellas
- Vrak av orlogsfartøyer fra 1700-tallet i norske farvann
- Kirkeskip som kilde til marinefartøyer på 1700-tallet
- Den norske iseksporten og sjøfarten i en internasjonal logistikk- og kostholdsrevolusjon ca. 1820-1920
- Fjellfiske og fiskevær i innlandet
- Saltproduksjon, fiske og fiskerettigheter i Oslofjorden
- Angelsaksisk innflytelse på den eldste norske by-, handels- og sjøfartslovgivingen
- Norsk og annen skandinavisk skipsfart på Kongofloden i kolonitiden
I tillegg drives det et kontinuerlig arbeid med å utvikle nye metoder i den arkeologiske forvaltningsarkeologien.
Kontaktpersoner for FoU-virksomheten
Seksjonsleder for forskning- og utstilling
Prosjektleder "The last Ice age"